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使用超级计算机预测信号蛋白

2021年4月20日星期二

在2018年11月一个看似普通的日子里,我收到了一封来自一家著名啤酒厂的重要电子邮件. 嘉士伯基金会给了我一个两年的奖学金,让我去牛津大学做研究. 2020年,我还有幸成为嘉士伯利纳克的研究员.

嘉士伯支持跨学科的科学, 我的博士后是在计算生物化学组. 马克桑塞姆. 正规网赌手机版,手机网赌软件下载的研究小组利用超级计算机来预测正规网赌手机版,手机网赌软件下载体内膜蛋白的特性. 其中一台超级计算机被放置在部门的地下室——它占据了整个房间.

我在牛津大学的研究致力于研究人类细胞中一种特殊类型的蛋白质. 这些蛋白质携带信息,启动或停止各种细胞过程,因此被称为信号蛋白. 我研究的信号蛋白之一是所谓的肿瘤抑制蛋白, PTEN(磷酸酶和张力同源物). 正规网赌手机版,手机网赌软件下载的身体在增殖(细胞分裂使细胞增殖)和凋亡(细胞死亡)之间保持着微妙的平衡。. 细胞凋亡增加可导致细胞死亡, 正如在阿尔茨海默氏症或帕金森症患者的大脑中观察到的那样. 增加扩散, 另一方面, 这是肿瘤细胞的特征之一吗, 哪些可能发展成癌症. PTEN通过限制增殖来维持增殖与凋亡平衡之间的重要平衡,因此被称为肿瘤抑制因子. PTEN由两个结构域(一个结构域是具有特定功能的蛋白质的一部分)组成:信号结构域, 还有一个辅助域. 辅助结构域称为C2,它将PTEN定位到细胞膜上,在那里它必须完成它的工作. 通过计算机模拟, 我研究了C2结构域与细胞膜结合的过程, i.e., 通过计算它们结合的紧密程度, 以及细胞膜改变时结构域的结合方向是如何改变的. 正规网赌手机版,手机网赌软件下载的研究结果提高了对这些辅助域的理解,并可能有助于更好地预防或治疗癌症和其他疾病, C2辅助域在哪里起作用.

牛津显然是一个伟大的科学环境,但也是一个可爱的城市. 我特别喜欢在Port Meadow散步和跑步,还喜欢和同事们一起逛酒吧. 我还曾在当地的一支球队踢足球,还参加了一个唱诗班, 牛津大学的歌手们(希望在疫情后恢复一些这些爱好). 一个传统, 我一定会把它带回丹麦, 英国人对圣诞套头衫热情吗. 我个人从同事那里得到了一件漂亮的霸王龙主题圣诞套头衫.

安德里亚斯·哈尔·拉森 中国科学院生物化学系博士后研究员